物語は、ギャング団・パッショーネにジョルノ・・ジョバァーナが入団し、 パッショーネのボスからであるトリッシュ・ウナからの命令で、
「カプリ島　男性用公衆トイレ　手前から４番」 と書かれた手紙の謎を調べるところから始まる。

ご存知、主人公ジョルノ・ジョバァーナは、マッドサイエンティストの シオバナ博士がジョナサン・ジョースターとDIOの遺伝子をあれこれして 生み出した最強の生命体。研究所で人体実験として生み出されたジョルノ （当時はハルノ＝シオバナ）であったが、研究員からは失敗作とみなされ、 廃棄処分が決定された。

絶望的とも思える状況のジョルノだったが、 研究所で大規模な爆発が発生し、行方をくらます。 その後、晴れてギャング団・パッショーネに入団することとなる。